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L'EC50 est la concentration d'un agoniste qui produit 50 % de son effet maximal. Plus elle est faible, plus la molécule est puissante sur le récepteur étudié.
L'EC50 dépend du système : niveau d'expression du récepteur, lecture utilisée (AMPc, β-arrestine), présence d'albumine dans le milieu. On ne peut comparer des EC50 qu'obtenues dans le même essai.
Les erreurs de concentration (teneur peptidique non corrigée, adsorption, dégradation) déplacent directement l'EC50. C'est l'une des raisons pour lesquelles la qualité du réactif compte autant en pharmacologie.
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