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Glossaire des peptides de recherche

44 définitions : chimie des peptides, contrôle analytique (HPLC, LC-MS, COA), manipulation et conservation, pharmacologie des récepteurs.

A

Acylation (lipidation) des peptides: L'acylation consiste à greffer une chaîne d'acide gras sur un peptide. Elle permet au peptide de se lier à l'albumine du sang et prolonge fortement sa durée d'action.
Adsorption des peptides: L'adsorption est la fixation d'un peptide sur la surface d'un tube, d'une pointe de pipette ou d'une plaque. Elle peut faire perdre une grande partie du peptide aux faibles concentrations, sans que l'on s'en aperçoive.
Agoniste: Un agoniste est une molécule qui se lie à un récepteur et l'active, en reproduisant l'effet du ligand naturel. Un antagoniste, à l'inverse, se lie sans activer et bloque le récepteur.
Aliquote: Une aliquote est une fraction d'une solution, répartie dans un tube séparé. Préparer des aliquotes à usage unique évite de congeler et décongeler plusieurs fois la même solution de peptide.
Amidation C-terminale: L'amidation C-terminale remplace le groupe carboxyle (–COOH) de la fin de chaîne par un amide (–CONH₂). Beaucoup d'hormones peptidiques naturelles sont amidées.
AMPc: L'AMPc (adénosine monophosphate cyclique) est un messager intracellulaire produit quand certains récepteurs couplés aux protéines G sont activés. Sa mesure est la lecture la plus courante pour les récepteurs GLP-1, GIP, glucagon et GHRH.
Amyline: L'amyline est une hormone peptidique de 37 acides aminés sécrétée par le pancréas avec l'insuline. Elle favorise la satiété, ralentit la vidange gastrique et freine le glucagon après le repas.

B

Biais de signalisation: Un agoniste biaisé active préférentiellement certaines voies d'un récepteur plutôt que d'autres, par exemple la voie de l'AMPc plutôt que le recrutement de la β-arrestine.

C

Certificat d'analyse (COA): Le certificat d'analyse (COA) est le document qui atteste des résultats de contrôle d'un lot précis : identité, pureté, masse, date d'analyse. Il doit correspondre au numéro de lot inscrit sur le flacon.
Chromatogramme: Le chromatogramme est le graphique produit par une HPLC : le temps en abscisse, le signal du détecteur en ordonnée. Chaque pic correspond à un composé ; l'aire du pic est proportionnelle à sa quantité.

D

Dégradation des peptides: Un peptide peut se dégrader par oxydation, désamidation, hydrolyse ou agrégation. Ces modifications réduisent l'activité et apparaissent comme des impuretés en HPLC ou des écarts de masse en LC-MS.
Demi-vie: La demi-vie est le temps nécessaire pour que la concentration d'une substance diminue de moitié. Pour les peptides, elle va de quelques minutes (GLP-1 natif) à environ une semaine (sémaglutide).
DPP-4: La DPP-4 (dipeptidyl peptidase-4) est une enzyme qui coupe les deux premiers acides aminés de nombreux peptides, dont le GLP-1, le GIP et la GHRH. Elle explique leur durée d'action très courte.

E

Eau bactériostatique: L'eau bactériostatique est une eau stérile contenant un conservateur, généralement 0,9 % d'alcool benzylique, qui freine la croissance des bactéries. Elle est utilisée pour les flacons prélevés plusieurs fois.
EC50: L'EC50 est la concentration d'un agoniste qui produit 50 % de son effet maximal. Plus elle est faible, plus la molécule est puissante sur le récepteur étudié.
Endotoxines: Les endotoxines sont des fragments de la paroi des bactéries (lipopolysaccharides) qui déclenchent une forte réponse inflammatoire. Elles peuvent contaminer un réactif et fausser les essais sur cellules immunitaires.

F

Fmoc: Le Fmoc (fluorénylméthoxycarbonyle) est un groupement protecteur temporaire de la fonction amine, utilisé dans la méthode de synthèse peptidique la plus répandue aujourd'hui.

G

Ghréline: La ghréline est une hormone de 28 acides aminés produite surtout par l'estomac. Elle stimule l'appétit et la libération d'hormone de croissance en activant le récepteur GHS-R1a.
GHRH: La GHRH (growth hormone-releasing hormone) est l'hormone de l'hypothalamus qui stimule la libération de l'hormone de croissance par l'hypophyse. C'est un peptide de 44 acides aminés.
GIP (récepteur et hormone): Le GIP (glucose-dependent insulinotropic polypeptide) est une hormone intestinale qui stimule la sécrétion d'insuline après un repas. Son récepteur, GIPR, est la seconde cible du tirzépatide et l'une des trois du rétatrutide.

H

HPLC: L'HPLC (chromatographie liquide haute performance) sépare les composants d'un échantillon en le faisant passer sous pression dans une colonne. C'est la méthode de référence pour mesurer la pureté d'un peptide.

I

IGF-1: L'IGF-1 (insulin-like growth factor 1) est une protéine de 70 acides aminés produite surtout par le foie sous l'effet de l'hormone de croissance. Elle médie une grande partie des effets de croissance de la GH.
Incrétine: Les incrétines sont des hormones intestinales libérées après un repas qui augmentent la sécrétion d'insuline en fonction du glucose. Les deux principales sont le GLP-1 et le GIP.

L

LC-MS: La LC-MS associe une chromatographie liquide à un spectromètre de masse. Elle sépare les composants puis mesure leur masse, ce qui permet de confirmer l'identité d'un peptide et d'identifier ses impuretés.
Liaison peptidique: La liaison peptidique est la liaison amide qui unit deux acides aminés : le groupe carboxyle de l'un réagit avec le groupe amine du suivant, en libérant une molécule d'eau.
Lyophilisation: La lyophilisation est un séchage par le froid : l'échantillon est congelé, puis l'eau est retirée sous vide par sublimation. Elle donne une poudre sèche, beaucoup plus stable que le peptide en solution.

M

Masse molaire: La masse molaire est la masse d'une mole de molécules, exprimée en g/mol. Pour un peptide, elle se calcule à partir de sa séquence et de ses modifications, et sert de référence pour vérifier son identité.

N

Numéro CAS: Le numéro CAS est un identifiant unique attribué à chaque substance chimique par le Chemical Abstracts Service. Il permet d'identifier une molécule sans ambiguïté, quel que soit son nom commercial.
Numéro de lot: Le numéro de lot identifie une production donnée d'un réactif. Il relie le flacon reçu à son certificat d'analyse et permet de retracer l'historique d'un résultat expérimental.

P

Peptide: Un peptide est une chaîne courte d'acides aminés reliés par des liaisons peptidiques. On parle généralement de peptide en dessous d'environ 50 acides aminés, et de protéine au-delà.
Pont disulfure: Un pont disulfure est une liaison covalente entre les atomes de soufre de deux cystéines. Il stabilise la forme du peptide et conditionne souvent son activité.
Pureté HPLC: La pureté HPLC est la part de l'aire du pic principal dans l'aire totale des pics détectés sur le chromatogramme. Une pureté de 99 % signifie que le pic du peptide représente 99 % du signal UV mesuré.

R

Récepteur du glucagon: Le récepteur du glucagon (GCGR) est activé par le glucagon, l'hormone qui fait monter la glycémie. Il agit surtout sur le foie et participe à la dépense énergétique. C'est la troisième cible du rétatrutide.
Récepteur GLP-1: Le récepteur GLP-1 (GLP-1R) est un récepteur couplé aux protéines G activé par l'hormone GLP-1. Il stimule la sécrétion d'insuline dépendante du glucose et agit sur l'appétit et la vidange gastrique.
Reconstitution: La reconstitution consiste à remettre en solution un peptide lyophilisé, avec un solvant et un volume choisis pour obtenir une concentration connue. C'est une étape clé pour la justesse des essais.
RUO (Research Use Only): RUO signifie « Research Use Only », usage recherche uniquement. Un produit RUO est destiné à des travaux de laboratoire. Il n'est ni un médicament, ni un dispositif médical, et ne doit pas être utilisé chez l'humain ou l'animal hors protocole encadré.

S

Sécrétagogue de l'hormone de croissance: Un sécrétagogue de GH est une substance qui fait libérer l'hormone de croissance par l'hypophyse. On distingue les analogues de la GHRH et les agonistes du récepteur de la ghréline (GHRP).
Sel d'acétate: La forme acétate est une forme sel d'un peptide où le contre-ion est l'acétate, plus doux pour les cellules que le trifluoroacétate (TFA). Elle est obtenue par échange de sel après la synthèse.
Sel de TFA (trifluoroacétate): La plupart des peptides de synthèse sont livrés sous forme de sel de trifluoroacétate (TFA), un résidu de leur synthèse et de leur purification. Le TFA est lié aux fonctions basiques du peptide.
Séquence peptidique: La séquence peptidique est l'ordre des acides aminés dans la chaîne, écrit de l'extrémité N-terminale (amine libre) vers l'extrémité C-terminale (carboxyle libre).
Spectrométrie de masse: La spectrométrie de masse mesure la masse des molécules après les avoir ionisées. Pour un peptide, elle confirme que la masse observée correspond à la masse théorique de la séquence attendue.
SPPS (synthèse peptidique en phase solide): La SPPS est la méthode standard de fabrication des peptides : la chaîne est construite acide aminé par acide aminé sur un support solide (une résine), puis détachée et purifiée.

T

Teneur peptidique (net peptide content): La teneur peptidique est la proportion de peptide réel dans la poudre pesée, une fois retirés l'eau et les contre-ions. Elle est souvent comprise entre 70 et 90 %, même pour un peptide très pur.
Triple agoniste: Un triple agoniste est une molécule unique qui active trois récepteurs différents. Le rétatrutide, qui active les récepteurs GIP, GLP-1 et glucagon, en est l'exemple le plus avancé.

Usage recherche uniquement (RUO). Produits destinés à la recherche scientifique en laboratoire. Non destinés à la consommation humaine ou animale, ni à un usage clinique, thérapeutique ou diagnostique. Aucun conseil médical n'est fourni.