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Un peptide peut se dégrader par oxydation, désamidation, hydrolyse ou agrégation. Ces modifications réduisent l'activité et apparaissent comme des impuretés en HPLC ou des écarts de masse en LC-MS.
| Oxydation | +16 Da |
|---|---|
| Désamidation | +1 Da |
Oxydation : surtout de la méthionine, du tryptophane et de la cystéine ; elle ajoute 16 Da par atome d'oxygène. Désamidation : l'asparagine et la glutamine se transforment en acide aspartique ou glutamique ; +1 Da, souvent favorisée en milieu basique. Hydrolyse : coupure de la chaîne, notamment près des acides aspartiques. Agrégation : les molécules s'assemblent et perdent leur activité.
La chaleur, la lumière, l'humidité, l'oxygène et les cycles de congélation accélèrent ces réactions.
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